再障的特点为全血细胞减少，诊断再障须除外下述类似疾病：
1、PNT　典型病例有血红蛋白尿发作，易与再障鉴别。不典型病例，临床主要为慢性贫血，外周血液中三系血细胞减少，骨髓也可增生减低，易被误为再障。
2、MDS－RA　多数RA主要表现为慢性进行性贫血，偶有皮肤出血点，血象示全血细胞减少，网织红细胞有时不增高，甚至降低，这些易与再障混淆。但RA以病态造血为特征，外周血显示红细胞大小不均，异形，偶见巨大红细胞及有核红细胞，单核细胞增多，可见幼稚粒细胞和巨大血小板。
3、急性白血病（AL）　特别是白细胞减少和低增生性AL可呈慢性过程，早期肝、脾、淋巴结未肿大，外周血全细胞减少，骨髓增生减低，易与再障混淆。仔细观察血象及多部位骨髓象，可发现原始粒、单、或原始淋巴细胞明显增多，骨髓活检也有助于再障的鉴别诊断。
4、骨髓纤维化(MF) 慢性病例常有脾肿大，外周血可见幼稚粒细胞和核红细胞，骨髓穿刺多次干抽，骨髓活检显示胶原纤维和(或)网状纤维明显增生。
5、恶性组织细胞病(MH) 常伴有非感染性高热，进行性衰竭，肝、脾、淋巴结肿大，黄疸、出血较重，外周血全血细胞减少。可见异常组织细胞，多部位骨髓检查可找到异常组织细胞，常有吞噬现象。借此可与再障鉴别。
6、急性造血功能停滞 本病常在溶血性贫血或感染发热的患者中发生，少数病例也可发生在缺铁性贫血、营养不良性和妊娠贫血等。在上述疾病患者因某些诱因如感染，尤为病毒感染，使外周血三系细胞尤其是红细胞骤然下降，网织红细胞可降至零，骨髓三系减少，故与再障相似。
7、骨髓转移瘤 骨髓中如有转移瘤也可以导致造血功能降低，血象可显示全血细胞减少，与再障相似。
8、单纯红细胞再生障碍　单纯红细胞再生障碍和再障在发病机制方面不同，前者主要影响红系造血祖细胞，后者主影响多能造血干细胞，因此前者仅表现为单纯红系统再障。
      
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